L’Etat indonésien reconnait six religions officielles dont : l'islam, le protestantisme, le catholicisme, l'hindouisme, le bouddhisme et le confucianisme.
La population indonésienne est majoritairement musulmane avec 90% de sa population enregistrée comme fidèles pratiquants de l'Islam.
Les chrétiens qui sont souvent partagés entre le catholicisme et le protestantisme représentent 7% de la population. Ils sont principalement répartis à l’est de l’archipel, sur les îles Flores, Timo ou Sumba.
2% de la population en Indonésie seulement sont des Hindouistes et 1% des Indonésiens pratiquent les religions : bouddhiste et confucianiste. On les retrouve principalement sur l'île de Bali.