Le pays a une grande diversité de climats, comme il s’étire sur 3 000 km de longueur. Les îles du Nord, comme Hokkaido, sont plus fraîches et connaissent des chutes de neige importantes en hiver alors que les îles du Sud sont de type tropical. Le climat est plus clément dans les régions centrales.
Le printemps, qui débute en mars et s’achève en avril, est propice pour visiter le japon et découvrir les magnifiques cerisiers en fleur.
L’été arrive en juin et persiste jusqu’au mois de septembre : les mois de juin et de juillet sont les plus arrosés, la chaleur est accablante en août, et des tempêtes violentes se déchaînent en septembre.
La température est modérée en automne (octobre-novembre) et les pluies sont beaucoup moins intenses.
L’hiver diffère selon les régions : très prononcé dans le Nord avec d’importantes chutes de neige et des températures descendant sous les -20° C, moins marqué dans le sud.